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今天下mit的lecture notes看了下
一、hamiltonian不随时间变化,与时间无关,这时时间演化算符非常简单;
二、hamiltionian与时有关,但不同时刻的彼此对易,这时时间演化算符也简单;
三、hamiltonian与时有关,并且不同时刻不对易,这时问题复杂了,所谓的编时算符要引入了。
after Molecular specification section, add lines like:
N1 N2 F
N1 N2 N3 N4 F
in this case,bond length between atom N1 and N2 are fixed. Similarly, the dihedral angle formed by N1 N2 N3 and N4 is also fixed.
分子模拟可以分为两大类,一类为分子动力学模拟(MD),根据原子间相互作用势,用经典力学处理体系中每个粒子随时间变化的运动途径。另一类是以概率论为基础的Monte Carlo模拟(MC),它不需要势能函数,采用简单取样或者权重分布,去构造一个Markov链。经过长期演算后,粒子逼近Boltzmann分布,然后通过统计平均,获得各种平均值。MC只提供系统的始态和终态的状况,不关心中间过程。